이스터섬에서 돌아온 이후,
평범한 일상으로 돌아온 케로로 일행.
그러던 어느 날,
침략 단속 기관인 ‘케론 헌병단’이 나타나서
케로로를 어딘지 모르는 곳으로 끌고 간다.
그리고 그들은 케로로에게
침략을 그만둘 것을 요구하는데…?!